Diversity of octylphenol polyethoxylate-degrading bacteria in river sediments and enrichment cultures, was revealed by 16S rRNA and adh1-gene molecular analysis
16S rRNAおよびadh1遺伝子解析による河川底泥およびその集積培養物におけるオクチルフェノールポリエトキシレート分解微生物の多様性

Akifumi Hosoda, Yudai Hotta, Toshiyuki Isoi, Satomi Amao, Akiyo Ito, Kozue Ueno, Hiromichi Yoshikawa, Hiroto Tamura
細田晃文，堀田雄大，磯井俊行，天尾聡見，伊藤明代，植野こずえ，吉川博道，田村廣人

日本農薬学会誌 35, 470-478 (2010) [抄録/PDF/電子付録]

化学物質曝露による微生物群集の自然適応について理解するために，岩田川底泥の集積培養物を用いて，微生物多様性とアルキルフェノールポリエトキシレート（APEO_n）の代表としてのオクチルフェノールポリエトキシレート（OPEO_n）生分解能の動的関係について精査した．界面活性剤を内分泌かく乱物質へ変換する河川底泥中の微生物の潜在能力を明らかにするために，6つの異なるサンプル中に存在する微生物のOPEO_n分解能を集積培養法により調査した．加えて，16S rRNA遺伝子に基づく変性剤濃度勾配ゲル電気泳動（DGGE）解析をOPEO_n分解微生物の集積前および集積後に行った．6つの底泥サンプル中のOPEO_n分解に関する潜在能力を予測するために機能遺伝子（adh1）のコピー数についても定量した．さらに，6つの底泥サンプルのうち3つのサンプルについて16S rRNA遺伝子に基づくクローン解析を行った．集積培養によるOPEO_n分解活性は6つの集積物のうち5つから検出された．しかし，クローン解析からは優占種を見出すことはできなかった．DGGE解析からOPEO_n分解に関与しているPseudomonas属が集積培養物中の主要な構成種の1つであることが明らかとなった．河川流量が比較的低い場合に，adh1遺伝子の計数量が比較的高いことが示された．これらの結果は，潜在的OPEO_n分解微生物は化学物質の曝露履歴が異なる岩田川に広く分布していることを示唆している．