Environmental distribution and novel high-throughput screening of APEO-degrading bacteria using matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-MS)
APEO分解微生物のクリークにおける分布とMALDI-MSを用いたハイスループットなスクリーニング

Yayoi Ichiki, Natsuki Ishizawa, Hiroto Tamura, Kanae Teramoto, Hiroaki Sato, Hiromichi Yoshikawa
市来弥生，石澤夏希，田村廣人，寺本華奈江，佐藤浩昭，吉川博道

日本農薬学会誌 33, 122-127 (2008) [抄録/PDF]

15ヶ所のクリーク土壌を対象にアルキルフェノールポリエトキシレート（APEO）分解微生物の分布について検討し，10ヶ所にEO鎖の短鎖化菌を，5ヶ所に末端酸化菌を見いだした．これらの集積培養液を，APEOを単一炭素源とする選択培地に塗布し，出現したコロニーから36コロニーを無作為に釣菌した．得られた単離菌をMALDI-MS，16S rDNAのRFLP, gyrB遺伝子解析によりグループ化した．RFLPでは全単離菌が1グループとして分類された．MALDI-MSでは3グループ，gyrB遺伝子解析では2グループに分類されたが，各グループを構成する単離菌はほぼ一致した．マスパターンによるグループとgyrBP. putidaと短鎖化能を持たないP. mendocinaに対応していた．